RStan 도입 정보

이토로

「시계열 분석과 상태 공간 모델의 기초 R과 Stan에서 배우는 이론과 실장」의 제6부 3장에서 사용하는 RStan의 도입에 대해 비망록(자신용).

07May'20: Written

도입 환경

OS: Mojave (version; 10.14.6)
R 버전: 3.6.3 (2020-02-29)
R Studio 버전: 1.2.5033

절차

C++ 컴파일러 도입

이전 버전의 RStan 지우기

RStan 패키지 다운로드

동작 확인

C++ 컴파일러 도입

Stan의 실행에 C++의 컴파일러가 필요하므로 적절히 넣는다.
CRAN 사이트에서 clang-7.0.0.pkg를 다운로드하여 설치했습니다.
htps : // c 란. rp 로지ぇct. rg/병/마코 sx/와 ls/

이전 버전의 RStan 삭제

이전 버전의 RStan을 지웠다.
RStudio의 콘솔에서 다음 명령을 실행했습니다.

remove.packages("rstan")
if (file.exists(".RData")) file.remove(".RData")

RStan 패키지 다운로드

다음 명령을 실행했습니다.

install.packages("rstan", repos = "https://cloud.r-project.org/", dependencies = TRUE)

동작 확인

동작 확인을 위해 이항 분포를 그려 보았다.

library(rstan)

x <- rbinom(n = 100, size = 20, prob = 0.8)
binomial_test <- "
      data {
      int N;
      int n;
      int x[n];
  }
  parameters {
      real<lower=0, upper=1> p;
  }
  model {
      x ~ binomial(N, p);
  } "
d <- list(N = 20, x = x, n = length(x))
fit <- stan(
      model_code = binomial_test ,
      data= d)

stan_hist(fit)

결과는 이하.


잘했다.

참조

· Mac에서 rstan 실행 환경 준비
ㅡㅡㅡㅜㅜㅜㅜ 하테나 bぉg. 코m/엔트리/2019/11/16/092734

· RStan Getting Started
htps : // 기주 b. 이 m / s tan-v / rs tan / uki / RS tan-Getchin g-S rd

· Stan을 이용한 이항 분포의 파라미터 추정 이항 분포
h tps : // s ts. 비파 pyu s. jp/바야시안-s들 s cs/s단/비만아 l. HTML