Python 은 집합 알고리즘 을 기반 으로 밀도 집합(DBSCAN)계산 을 실현 합 니 다[테스트 사용 가능]

본 논문 의 사례 는 Python 이 집합 알고리즘 을 바탕 으로 밀도 집합(DBSCAN)계산 을 실현 하 는 것 을 다 루 었 다.여러분 께 참고 하도록 공유 하 겠 습 니 다.구체 적 으로 는 다음 과 같 습 니 다.
알고리즘 사상
밀 도 를 바탕 으로 하 는 집합 알고리즘 은 견본 밀도 의 측면 에서 견본 간 의 연결 성 을 고찰 하고 연결 가능 한 견본 을 바탕 으로 집합 을 계속 확장 하여 최종 결 과 를 얻 을 수 있 습 니 다.
몇 가지 필요 한 개념:
ε-인접 지역:견본 집중 xj,그것 의ε-인접 도 메 인 은 견본 으로 집중 되 어 그것 과 거리 가 작다.ε샘플 로 구 성 된 집합.
핵심 대상:만약 xj 의ε-인접 도 메 인 에 최소 MinPts 샘플 이 포함 되 어 있 으 면 xj 는 핵심 대상 입 니 다.
밀도 직통:만약 xj 가 xi 에 있다 면ε-이웃 지역 에서 xi 를 핵심 대상 으로 하면 xj 는 xi 밀도 에서 직통 한다.
밀 도 는 다음 과 같다:만약 견본 서열 p1,p2,...,pn.pi+1 은 pi 밀도 로 직통 하면 p1 은 pn 밀도 로 도달 할 수 있 습 니 다.
대체적인 사상 은 다음 과 같다.
1.핵심 대상 집합 T 를 비 워 두 고 샘플 집합 D 의 모든 샘플 을 옮 겨 다 니 며 각 샘플 점 을 계산 합 니 다.ε-인접 도 메 인 에 포 함 된 견본 의 개 수 는 개수 가 MinPts 보다 크 면 이 견본 점 을 핵심 대상 집합 에 추가 합 니 다.클 러 스 터 수 k=0 을 초기 화하 고 접근 하지 않 은 샘플 집합 과 P=D 를 초기 화 합 니 다.
2.T 집합 에 견본 이 존재 할 때 다음 절 차 를 수행 합 니 다.
  • 2.1 현재 방문 하지 않 은 집합 P 기록old = P
  • 2.2 T 에서 핵심 대상 o 를 무 작위 로 선택 하여 하나의 대기 열 을 초기 화 합 니 다.Q=[o]
  • 2.3P=P-o(T 에서 o 삭제)
  • 2.4 Q 에 견본 이 존재 할 때 집행:
  • 2.4.1 추출 대기 열의 첫 번 째 견본 q
  • 2.4.2 계산 q 의ε-인접 도 메 인 에 포 함 된 견본 의 개 수 는 MinPts 보다 크 면 S 를 q 로 합 니 다.ε-인접 지역 과 P 의 교차,
    Q = Q+S, P = P-S
  • 2.5 k=k+1,클 러 스 터 생 성 Ck=Pold - P
  • 2.6 T = T - Ck
  • 3.C={C1,C2,...,Ck}로 나 누 기
    Python 코드 구현
    
    #-*- coding:utf-8 -*-
    import math
    import numpy as np
    import pylab as pl
     #   :              ,  ,   
    data = """
    1,0.697,0.46,2,0.774,0.376,3,0.634,0.264,4,0.608,0.318,5,0.556,0.215,
    6,0.403,0.237,7,0.481,0.149,8,0.437,0.211,9,0.666,0.091,10,0.243,0.267,
    11,0.245,0.057,12,0.343,0.099,13,0.639,0.161,14,0.657,0.198,15,0.36,0.37,
    16,0.593,0.042,17,0.719,0.103,18,0.359,0.188,19,0.339,0.241,20,0.282,0.257,
    21,0.748,0.232,22,0.714,0.346,23,0.483,0.312,24,0.478,0.437,25,0.525,0.369,
    26,0.751,0.489,27,0.532,0.472,28,0.473,0.376,29,0.725,0.445,30,0.446,0.459"""
    #     dataset 30   (  ,   )   
    a = data.split(',')
    dataset = [(float(a[i]), float(a[i+1])) for i in range(1, len(a)-1, 3)]
    #        ,a,b       
    def dist(a, b):
      return math.sqrt(math.pow(a[0]-b[0], 2)+math.pow(a[1]-b[1], 2))
    #    
    def DBSCAN(D, e, Minpts):
      #         T,    k,    C,      P,
      T = set(); k = 0; C = []; P = set(D)
      for d in D:
        if len([ i for i in D if dist(d, i) <= e]) >= Minpts:
          T.add(d)
      #    
      while len(T):
        P_old = P
        o = list(T)[np.random.randint(0, len(T))]
        P = P - set(o)
        Q = []; Q.append(o)
        while len(Q):
          q = Q[0]
          Nq = [i for i in D if dist(q, i) <= e]
          if len(Nq) >= Minpts:
            S = P & set(Nq)
            Q += (list(S))
            P = P - S
          Q.remove(q)
        k += 1
        Ck = list(P_old - P)
        T = T - set(Ck)
        C.append(Ck)
      return C
    #  
    def draw(C):
      colValue = ['r', 'y', 'g', 'b', 'c', 'k', 'm']
      for i in range(len(C)):
        coo_X = []  #x    
        coo_Y = []  #y    
        for j in range(len(C[i])):
          coo_X.append(C[i][j][0])
          coo_Y.append(C[i][j][1])
        pl.scatter(coo_X, coo_Y, marker='x', color=colValue[i%len(colValue)], label=i)
      pl.legend(loc='upper right')
      pl.show()
    C = DBSCAN(dataset, 0.11, 5)
    draw(C)
    
    
    이 컴퓨터 테스트 실행 결과 그림:

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