파이썬 환경 구축 메모 (Anaconda, biopython)
0_ 처음에
실험실에서 Python을 사용하기 때문에 생물 시스템에 필요한 패키지를 설치하려고했습니다.
조사해 보면 데이터 분석계의 패키지는 대체로 Anaconda에 있는 것 같기 때문에 그것을 넣기로 했다
또한 FASTA 파일을 읽고 싶었기 때문에 Biopython을 넣었습니다.
사용한 환경은 아래에
OS:Widows 10 Home
Anaconda3: 5.0.0
1_Anaconda 설치
먼저 Windows 용 설치 프로그램을 다음에서 다운로드했습니다.
자신은 Python3.6version의 64bit 버전을 다운로드했다.
htps //w w. 아나 곤다. 코 m / 도 w 응 아 d /
다운로드 후 설치 프로그램을 시작하고 설치를 완료합니다.
이 때, 설치처의 장소를 기록해 두면 좋다(할 것)
아래 사이트를 참고하면 좋다고 생각합니다.
http://pythondatascience.plavox.info/python%E3%81%AE%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3% 83%AB/python%E3%81%AE%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3%83%AB-windows
2 Python 경로를 통과
명령 프롬프트를 열고 파이썬 실행을 확인하십시오.
이런 식으로 표시되면 OK,
| Anaconda, Inc | 문자가 없으면 Python과 Anaconda 경로가 없으므로 다음을 참조하여 경로를 통과하십시오. 자신의 경우 C :\ProgramData\Anaconda3
3_biopython 설치
Anaconda 속에 biopython은 들어 있지 않은 것 같기 때문에 추가하고 싶다.
프록시가 존재하는 경우 .condarc 파일을 작성하고 프록시를 설정해야합니다 (학내 회선의 경우 필수).
또한 학내 회선에 연결할 때 id와 password가 필요한 경우,
http://사용자 ID:암호@프록시 주소:포트 번호
라고 써야 할 필요가 있다
htps : // 코 m / 미 짱 88 / ms / 2f9 1c5 9 2572 8 36 을 참고하면 된다.
그런 다음 Cortana 등에서 AnacondaNavigator를 검색하고 관리자 권한으로 시작
(관리자 권한으로 기동하지 않으면 쓸 수 없기 때문에 에러가 된다.)
시작 후 Enviroment를 선택하고 installed를 Notinstalled로 변경하고 검색 필드에 biopython을 입력하십시오.
패키지에 체크를 넣으면 오른쪽 하단에 Apply가 출현하기 때문에 실행.
4_에디터 정보
파이썬을 실행하는 편집기에 대해,
아나콘다를 설치했을 때에 오는 jupyternotebook에서도 좋다
AnacondaNavigator에서 부팅 가능
Reference
이 문제에 관하여(파이썬 환경 구축 메모 (Anaconda, biopython)), 우리는 이곳에서 더 많은 자료를 발견하고 링크를 클릭하여 보았다
https://qiita.com/hukuhuku11111a1/items/c6f995fb993ec51a6ec3
텍스트를 자유롭게 공유하거나 복사할 수 있습니다.하지만 이 문서의 URL은 참조 URL로 남겨 두십시오.
우수한 개발자 콘텐츠 발견에 전념
(Collection and Share based on the CC Protocol.)
먼저 Windows 용 설치 프로그램을 다음에서 다운로드했습니다.
자신은 Python3.6version의 64bit 버전을 다운로드했다.
htps //w w. 아나 곤다. 코 m / 도 w 응 아 d /
다운로드 후 설치 프로그램을 시작하고 설치를 완료합니다.
이 때, 설치처의 장소를 기록해 두면 좋다(할 것)
아래 사이트를 참고하면 좋다고 생각합니다.
http://pythondatascience.plavox.info/python%E3%81%AE%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3% 83%AB/python%E3%81%AE%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3%83%AB-windows
2 Python 경로를 통과
명령 프롬프트를 열고 파이썬 실행을 확인하십시오.
이런 식으로 표시되면 OK,
| Anaconda, Inc | 문자가 없으면 Python과 Anaconda 경로가 없으므로 다음을 참조하여 경로를 통과하십시오. 자신의 경우 C :\ProgramData\Anaconda3
3_biopython 설치
Anaconda 속에 biopython은 들어 있지 않은 것 같기 때문에 추가하고 싶다.
프록시가 존재하는 경우 .condarc 파일을 작성하고 프록시를 설정해야합니다 (학내 회선의 경우 필수).
또한 학내 회선에 연결할 때 id와 password가 필요한 경우,
http://사용자 ID:암호@프록시 주소:포트 번호
라고 써야 할 필요가 있다
htps : // 코 m / 미 짱 88 / ms / 2f9 1c5 9 2572 8 36 을 참고하면 된다.
그런 다음 Cortana 등에서 AnacondaNavigator를 검색하고 관리자 권한으로 시작
(관리자 권한으로 기동하지 않으면 쓸 수 없기 때문에 에러가 된다.)
시작 후 Enviroment를 선택하고 installed를 Notinstalled로 변경하고 검색 필드에 biopython을 입력하십시오.
패키지에 체크를 넣으면 오른쪽 하단에 Apply가 출현하기 때문에 실행.
4_에디터 정보
파이썬을 실행하는 편집기에 대해,
아나콘다를 설치했을 때에 오는 jupyternotebook에서도 좋다
AnacondaNavigator에서 부팅 가능
Reference
이 문제에 관하여(파이썬 환경 구축 메모 (Anaconda, biopython)), 우리는 이곳에서 더 많은 자료를 발견하고 링크를 클릭하여 보았다
https://qiita.com/hukuhuku11111a1/items/c6f995fb993ec51a6ec3
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프록시가 존재하는 경우 .condarc 파일을 작성하고 프록시를 설정해야합니다 (학내 회선의 경우 필수).
또한 학내 회선에 연결할 때 id와 password가 필요한 경우,
http://사용자 ID:암호@프록시 주소:포트 번호
라고 써야 할 필요가 있다
htps : // 코 m / 미 짱 88 / ms / 2f9 1c5 9 2572 8 36 을 참고하면 된다.
그런 다음 Cortana 등에서 AnacondaNavigator를 검색하고 관리자 권한으로 시작
(관리자 권한으로 기동하지 않으면 쓸 수 없기 때문에 에러가 된다.)
시작 후 Enviroment를 선택하고 installed를 Notinstalled로 변경하고 검색 필드에 biopython을 입력하십시오.
패키지에 체크를 넣으면 오른쪽 하단에 Apply가 출현하기 때문에 실행.
4_에디터 정보
파이썬을 실행하는 편집기에 대해,
아나콘다를 설치했을 때에 오는 jupyternotebook에서도 좋다
AnacondaNavigator에서 부팅 가능
Reference
이 문제에 관하여(파이썬 환경 구축 메모 (Anaconda, biopython)), 우리는 이곳에서 더 많은 자료를 발견하고 링크를 클릭하여 보았다
https://qiita.com/hukuhuku11111a1/items/c6f995fb993ec51a6ec3
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