CentOS7.9@wsl2에 Intel oneAPI(intel compiler) 환경을 구축한다.

몇 가지 소개 되어 있는 것처럼, Intel의 컴파일러＆라이브러리인 Intel oneAPI를 무료로 사용할 수 있으므로 CentOS7.9@wsl2에 인스톨 해 봅니다.
컴파일러&MPI&MKL(수치 계산 라이브러리)를 넣고 싶기 때문에 BaseKit와 HPCkit를 인스톨 했습니다.

wsl2라면, gcc계도 들어 있지 않은 것 같고, 조금 넘어지기 때문에 기록합니다.
함께 확인에 사용한 아래의 hello 프로그램도 기재해 둡니다.

Fortran (with OpenMP, MPI)

C (with MPI)

C++ (with MPI)

(유익하면 LGTM 부탁드립니다)

설치한 환경

wsl2에서 CentOS7.9를 넣은 상태 (아래 참조)
htps : // 코 m / 에오 / ms / 세 d8345 아 fb0 에c383 9

GCC 준비

gcc를 Online으로 설치한다.
참조한 URL: htps //w w. 가 드게 ts-다 y. 네 t/? p=806
아래를 root로 실행.
우선, 현재 상태와 설치할 수 있는 버전을 확인

$ which gcc
# 結果
/usr/bin/which: no gcc in (:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:)

$ yum info gcc
# 結果(一部掲載)
Available Packages
Name        : gcc
Version     : 4.8.5

$ yum info gcc-c++
#結果
Name        : gcc-c++
Version     : 4.8.5

$ yum info gcc-gfortran
# 結果
Name        : gcc-gfortran
Version     : 4.8.5

이어서 설치

$ yum install gcc
$ yum install gcc-c++
$ yum install gcc-gfortran
# Dependencyも含めてインストール、Updateしてくれる。

# gcc-c++で確認
$ which g++
#結果
/usr/bin/g++

$ g++ --version
#結果
g++ (GCC) 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-44)
Copyright (C) 2015 Free Software Foundation, Inc.

intel OneAPI 설치.

BaseKit과 HPCkit을 다운로드합니다. 이곳은 오프라인 버전으로 작업합니다.
참고 사이트: htps : // 이 m / m ぃし t_ 네 / ms / 35bc4 8f2022903747
을 바탕으로, 아래의 파일 2개를 다운로드.

아래 두 가지 다운로드
l_BaseKit_p_2021.1.0.2659_offline.sh
l_HPCKit_p_2021.1.0.2684_offline.sh

설치

#まずはBaseKit
sudo bash l_BaseKit_p_2021.1.0.2659_offline.sh
#次にHPCKit
sudo bash l_HPCKit_p_2021.1.0.2684_offline.sh

각각 실행하면 아래와 같은 GUI 화면이 나옵니다.
End User License Agreement에 동의하면,
Accept & install로 진행합니다.
특정 프로그램만 설치하고 싶은 경우는 Accept & configura installation을 적절히 체크를 해제해 주세요.

설정

설치 폴더인 setvars.sh를 실행하면 경로를 통해 줍니다.

$ source /opt/intel/oneapi/setvars.sh
$ which ifort
#実行結果
/opt/intel/oneapi/compiler/2021.1.1/linux/bin/intel64/ifort
$ ifort --version
#実行結果
ifort (IFORT) 2021.1 Beta 20201112
Copyright (C) 1985-2020 Intel Corporation.  All rights reserved.

hello 프로그램을 실행하여 확인합니다.

여기에서 일반 사용자로 실행합니다.
우선, 로그인시에 패스가 통과하도록 설정한다.

# ~/.bashrcに下記を加える。
source  /opt/intel/oneapi/setvars.sh

#bashrcの再読み込み
$source ~/.bashrc
#確認
$ ifort --version
$ which ifort
#実行結果
/opt/intel/oneapi/compiler/2021.1.1/linux/bin/intel64/ifort

Fortran 계열

보통 Fortran

움직이는 프로그램은

hello.f90

program hello
  write(*,*) 'hello,world!'
end program hello

실행.

$ ifort hello.f90 -o hello.exe
$ ./hello.exe
#実行結果
 hello, world!

MPI Fortran

참고 : htps : // 쿠 rc. Red d. cs. 이오 / 엔 / ㅁ st / p 로그 라민 g / M 피 푸 rt 란. HTML
움직이는 프로그램은

hello_mpi.f90

     PROGRAM hello_mpi
     include 'mpif.h'

     integer rank, size, ierror, tag
     character node*20

     call MPI_INIT(ierror)
     call MPI_COMM_SIZE(MPI_COMM_WORLD, size, ierror)
     call MPI_COMM_RANK(MPI_COMM_WORLD, rank, ierror)
     call MPI_Get_processor_name(node, node_len, ierror)
     write(*,*) 'hello, world! @ ',node, rank, 'of ', size

     call MPI_FINALIZE(ierror)
     END PROGRAM

실행.

$ mpiifort hello_mpi.f90 -o hello_mpi.exe
#↓ 実行するとき"./"を省略しない
$ mpirun -n 3 ./hello_mpi.exe
#実行結果
 hello, world! @ node1                1 of            3
 hello, world! @ node1                2 of            3
 hello, world! @ node1                0 of            3

openMP fortran

hello_omp.f90

program hello_omp
  !$ use omp_lib
  !$omp parallel
   write(*,*) "hello, world @",omp_get_thread_num(),"of",omp_get_num_threads()
  !$omp end parallel
end program hello_omp

실행해보십시오.

$ ifort -qopenmp hello_omp.f90 -o hello_omp.exe
#環境変数OMP_NUM_THREADSに並列化したいthreads数を指定
$ export OMP_NUM_THREADS=4
$ ./hello_omp.exe
#実行結果
 hello, world @           0 of           4
 hello, world @           2 of           4
 hello, world @           3 of           4
 hello, world @           1 of           4

#ちなみにoptionを"-openmp"にすると下記。wsl2だから？
$ ifort -openmp hello_omp.f90 -o hello_omp.exe
#実行結果
ifort: command line error: option '-openmp' is not supported. Please use the replacement option '-qopenmp'

C계

일반 C

hello.c

#include <stdio.h>
main( )
{
  printf("hello, world\n");
}

$ icc hello.c -o hello.exe
$ ./hello.exe
#実行結果
hello, world

MPI C

참고 : htps // m 피트리어 l. 코 m / 쓰리 아 ls / m 피 - ぉ - rld /

hello_mpi.c

#include <mpi.h>
#include <stdio.h>

int main(int argc, char** argv) {
    MPI_Init(NULL, NULL);
    int size;
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
    int rank;
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
    char node[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
    int name_len;
    MPI_Get_processor_name(node, &name_len);
    printf("hello, world @ %s, %d of %d \n",node, rank, size);
    MPI_Finalize();
}

$ mpiicc hello_mpi.c -o hello_mpi.exe
$ mpirun -n 5 ./hello_mpi.exe
#実行結果
hello, world @ node1, 1 of 5
hello, world @ node1, 3 of 5
hello, world @ node1, 0 of 5
hello, world @ node1, 2 of 5
hello, world @ node1, 4 of 5

C++계

보통

hello.cpp

#include <iostream>
using namespace std;
int main(){
  cout << "hello, world" << endl;
  return 0;
}

$ icpc hello.cpp -o hello.exe
$ ./hello.exe
#実行結果
hello, world

MPI C++

프로그램은 hello_mpi.c와 동일한 것을 hello_mpi.cpp로 실행

$ mpiicpc hello_mpi.cpp -o hello_mpi.exe
$ mpirun -n 2 ./hello_mpi.exe
#実行結果
hello, world @ node1, 1 of 2
hello, world @ node1, 0 of 2

(보충) GCC에서 실행하는 경우

gcc계에서 실행하는 경우는, 아래의 표에 따라 컴파일시의 커멘드를 읽어내면 실행 가능합니다.



nomal
MPI
OpenMP


인텔
ifort
mpiifort
ifort -qopenmp

gcc
gfortran
mpif90
gfortran -fopenmp




nomal
MPI


인텔
icc
mpiicc

gcc
cc/gcc
mpicc




nomal
MPI


인텔
icpc
mpiicpc

gcc
g++/cpp
mpicxx


(mpif90, mpicc은/opt/intel/oneapi/mpi/2021.1.1/bin에 링크되어 있습니다.
intelOneAPI를 넣지 않은 경우 OpenMPI 등이 필요)