RDKit의 방향환 판정에 대한 실험 노트

805 단어 RDKit

개시하다


위 제목은 SDF와 SMILES가 균열 구조식으로 제시한 구조가 방향고리로 판정된 것이 아닌지 갑자기 조금 의문이 들어 실험 당시 노트입니다.

컨디션

  • Python 3.6
  • RDKit 2018/9/2
  • Jupyter Notebook
  • 해본 일


    먼저 균열 구조식으로 벤젠 고리를 써서 표시한다.
    from rdkit import Chem
    from rdkit.Chem import AllChem, Draw, Descriptors, PandasTools
    from rdkit.ML.Descriptors import MoleculeDescriptors
    
    mol1 = Chem.MolFromSmiles("C1=CC=CC=C1")
    Draw.MolToImage(mol1)
    
    

    MOL 객체에 대한 출력 방향 루프 수, 다시 SMILES화된 수량
    Descriptors.NumAromaticRings(mol1)
    1
    Chem.MolToSmiles(mol1)
    'c1ccccc1'
    
    응, 방향환으로 여겨지는 것 같아.

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