[BOJ] 1969. DNA
1. 문제
DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오티드의 첫글자를 따서 표현한다. 만약에 Thymine-Adenine-Adenine-Cytosine-Thymine-Guanine-Cytosine-Cytosine-Guanine-Adenine-Thymine로 이루어진 DNA가 있다고 하면, “TAACTGCCGAT”로 표현할 수 있다. 그리고 Hamming Distance란 길이가 같은 두 DNA가 있을 때, 각 위치의 뉴클오티드 문자가 다른 것의 개수이다. 만약에 “AGCAT"와 ”GGAAT"는 첫 번째 글자와 세 번째 글자가 다르므로 Hamming Distance는 2이다.
우리가 할 일은 다음과 같다. N개의 길이 M인 DNA 가 주어져 있을 때 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA 를 구하는 것이다. 즉, 와 의 Hamming Distance + 와 의 Hamming Distance + 와 의 Hamming Distance ... 의 합이 최소가 된다는 의미이다.
2. 입력
첫 줄에 DNA의 수 N과 문자열의 길이 M이 주어진다. 그리고 둘째 줄부터 N+1번째 줄까지 N개의 DNA가 주어진다. N은 1,000보다 작거나 같은 자연수이고, M은 50보다 작거나 같은 자연수이다.
3. 출력
첫째 줄에 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA 를 출력하고, 둘째 줄에는 그 Hamming Distance의 합을 출력하시오. 그러한 DNA가 여러 개 있을 때에는 사전순으로 가장 앞서는 것을 출력한다.
4. 풀이
from collections import Counter
N, M = map(int, input().split())
dna = [input() for _ in range(N)]
# 각 자리의 알파벳 중 가장 많이 나오는 것을 선택
result = ''
for i in range(M):
li = sorted([dna[j][i] for j in range(N)])
result += Counter(li).most_common(1)[0][0]
print(result)
# 해밍 거리 계산
cnt = 0
for i in range(M):
for j in range(N):
if result[i] != dna[j][i]:
cnt += 1
print(cnt)
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