메타다 QIIME2의 메타데이터에 Alpha 다양성을 추가하여 해석을 편하게 한다 QIIME2에서는 데이터가 qza에 저장되어 qzv로 변환하여 시각화 할 수 있습니다. qza에서 qzv로 하면, 내에서 가시화할 수 있어, 인터랙티브하게 도표를 확인하거나 할 수 있다. 하지만, QIIME2의 디폴트의 그래프는 까다롭고, 결국 모두 「Download raw data as TSV」라든지로 출력해, R의 ggplot 라든지 Python의 matplotlib 에 데이터를 다시 넣... ShellScriptMicrobiomeQIIME2메타다 MetaData 수집 편지지 (PysimpleGUI,HTML) 데이터를 수집할 때 해당 데이터에 대한 설명인 메타데이터도 동시에 수집하는 것이 중요합니다. 데이터를 제공해 주는 사람에게 「데이터의 설명을 붙여 주세요」라고 부탁해도 꽤 어렵기 때문에, 이쪽에서 미리 데이터 설명의 템플릿을 붙일 필요가 있습니다. 가장 간단한 것은 EXCEL입니다만, 포맷이 마음대로 바뀌고 있거나 의외로, 그 후의 처리가 귀찮은 일이 있습니다. 그래서 (1) HTML의 Fi... JSONHTML파이썬메타다PySimpleGUI
QIIME2의 메타데이터에 Alpha 다양성을 추가하여 해석을 편하게 한다 QIIME2에서는 데이터가 qza에 저장되어 qzv로 변환하여 시각화 할 수 있습니다. qza에서 qzv로 하면, 내에서 가시화할 수 있어, 인터랙티브하게 도표를 확인하거나 할 수 있다. 하지만, QIIME2의 디폴트의 그래프는 까다롭고, 결국 모두 「Download raw data as TSV」라든지로 출력해, R의 ggplot 라든지 Python의 matplotlib 에 데이터를 다시 넣... ShellScriptMicrobiomeQIIME2메타다 MetaData 수집 편지지 (PysimpleGUI,HTML) 데이터를 수집할 때 해당 데이터에 대한 설명인 메타데이터도 동시에 수집하는 것이 중요합니다. 데이터를 제공해 주는 사람에게 「데이터의 설명을 붙여 주세요」라고 부탁해도 꽤 어렵기 때문에, 이쪽에서 미리 데이터 설명의 템플릿을 붙일 필요가 있습니다. 가장 간단한 것은 EXCEL입니다만, 포맷이 마음대로 바뀌고 있거나 의외로, 그 후의 처리가 귀찮은 일이 있습니다. 그래서 (1) HTML의 Fi... JSONHTML파이썬메타다PySimpleGUI