정지 합성 보건도

TL；박사 01 명

Docker 에셋을 다음과 같이 조정합니다.

Min 4    CPUs
Min 8GB  Memory
Min 2GB  Swap
Min 50GB Disk

Docker Desktop 실행 시 다음 명령(CLI)을 실행합니다.

wget https://bit.ly/tg_workshop -O deploy_ws.sh && chmod +x deploy_ws.sh && ./deploy_ws.sh 2

Note: you should read this blog to set up your environment correctly or it might fail

배경.

이 가능하다, ~할 수 있다,...

이 블로그는 무엇에 관한 것입니까?

관심 분야

그래픽 데이터베이스란 무엇입니까?

Synthea 란 무엇입니까?

Note: skip to next to get started if you don't care about context

먼저 이러한 질문에 답한 다음 의료 차트 솔루션을 시작하는 방법에 대해 살펴보겠습니다.

이 블로그는 무엇에 관한 것입니까?

실제 의료 보건 도면 해결 방안을 모의하는 합성 의료 보건 도면을 어떻게 배치하는지 보여 줍니다. 예를 들어 Docker,Gradle, TigerGraph를 사용합니다.

왜 나는 이것에 대해 흥미를 느낄까?

너는 도형 데이터베이스에 대해 들은 적이 있을지 모르지만, 어디서부터 시작해야 할지 모른다.이 프로젝트는 완전히 스크립트화된 도형 해결 방안을 구축하는 데 도움을 줄 것입니다.이 프로젝트를 자신의 그래픽 솔루션을 구축하는 템플릿으로 사용할 수 있습니다.

무엇이 도형 데이터베이스입니까?

도형 구조를 이용하여 의미 조회를 하고 노드, 변과 속성을 사용하여 데이터를 표시하고 저장하는 데이터베이스.[1]
시스템의 관건적인 개념은 그림(또는 변 또는 관계)이다.이 그림은 저장된 데이터 항목을 노드와 변의 집합과 연결시키고 이 변들은 노드 간의 관계를 나타낸다.
이러한 관계를 통해 저장된 데이터를 직접 연결할 수 있으며, 많은 경우 한 번의 조작만으로 데이터를 검색할 수 있다.
도형 데이터베이스는 데이터 간의 관계를 우선적으로 고려한다.조회 관계는 매우 빠르다. 왜냐하면 그것들은 영원히 데이터베이스에 저장되기 때문이다.

Synthea 소개

Synthea는 소스를 생성한 합성 환자 생성기로, 합성 환자의 병력을 시뮬레이션하는 데 쓰인다.그 목적은 고품질, 합성, 진실하지만 비진실한 환자 데이터와 관련 건강 기록을 제공하고 의료 보건의 각 방면을 포괄하는 것이다.

개시하다

선결 조건

wget

부두 노동자

docker compose

wget

아직 설치되지 않은 경우 wget을 다운로드해야 합니다.이 작업을 수행하려면 해당 다운로드 지침으로 이동합니다.

Linux

Windows

Mac

부두 노동자

예쁜 GUI 인터페이스로 docker를 실행하고 싶다면, 가장 간단한 방법은 docker 데스크톱의 최신 버전을 가져오는 것입니다. https://www.docker.com/products/docker-desktop을 다운로드할 수 있습니다.

Note: for this tutorial, we will be showing Docker Desktop screen captures

그렇지 않으면 Docker 엔진을 잡고 다음과 같은 링크를 조합할 수 있습니다: Docker과 Docker-Compose

Note: you will want Version > 1.25 of Docker Compose

Docker 구성 설정

자원 설정

설정 버튼(Docker 바탕 화면 오른쪽 상단)을 클릭합니다.다음은 참고 자료를 클릭하고 고급을 눌러주세요.비슷한 화면이 보일 것입니다:

TigerGraph 실행에 필요한 리소스를 충족시키려면 다음을 추가해야 합니다.

Min 4    CPUs
Min 8GB  Memory
Min 2GB  Swap
Min 50GB Disk

그런 다음 적용 을 클릭하고 다시 시작합니다.설정은 다음과 같습니다.

바인딩 설정

귀속을 추가합시다.다음은 기본 귀속의 예입니다.이 프로젝트에 대해 새 디렉터리를 귀속에 추가합니다.

이 프로젝트가 주재할 전문적인 목록을 가지고 있는 것을 권장합니다.디렉토리를 생성하지 않은 경우 다음 단계를 수행합니다.

# Choose the appropriate location
# For this example we will just use a directory of the user
# Open Terminal and run the following:
$ cd
$ mkdir workspace
# cd workspace
#If you plan to do a few different builds you can make separate project folders in your new directory. Ex:
$ mkdir synthea

그런 다음 + 버튼을 클릭하고 생성한 디렉토리의 경로를 입력합니다.완료되면 Apply & Restart 를 클릭하십시오.다음은 바인딩의 예입니다.

설치 실행

지금이 마지막이야.Docker Desktop이 실행 중인 경우 터미널에서 다음 명령을 실행합니다.

wget https://bit.ly/tg_workshop -O deploy_ws.sh && chmod +x deploy_ws.sh && ./deploy_ws.sh 2

다음은 당신이 보기 시작할 내용입니다.셸 스크립트를 실행하여 최신 TigerGraph 이미지를 다운로드하고 의료 그래픽 솔루션을 구축하기 전에 시작합니다.

다음에 너는 호랑이 기계가 운행하고 있는 것을 보게 될 것이다.URL http://localhost:14240을 찾아서 브라우저에 붙여넣기

URL을 열고 도면을 보면 TigerGraph box가 제대로 작동하는지 알 수 있습니다.

다음 일은 터미널 데이터 파일이 추가되고 불러오는 것을 볼 수 있습니다.

마지막으로 사전 제작된 쿼리가 설치되어 있습니다.

전체 과정은 대략 5-10분 걸린다.GraphStudio로 돌아가 Load data(데이터 로드)를 클릭하여 데이터 로드를 확인할 수 있습니다.오른쪽에서, 너는 숫자가 상승하고 있다는 것을 주의해야 한다.

더 알고 싶으세요?

프로젝트 구축은 이것으로 끝냅니다.Sythea 솔루션이 어떻게 개발되었는지 자세히 알고 싶으시면 Akash Kaul:을 통해 두 블로그를 확인하시기 바랍니다.

도형 데이터베이스 기반 의료 데이터 모델링

TigerGraphe 및 Synthea를 사용하여 합성 의료 시스템 생성

3차원 의료 네트워크 그래프를 설계하다

TigerGraph, Python, JavaScript를 사용하여 의료 데이터를 모델링하는 멋진 방법
리소스

TG Community Forum

TG Community Chat

TG Developer Portal

Reddit

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GitHub

증명하다
[1] 니콜라스 G 부르크스(1998년).인공지능과 자동화.세계 과학.p、 381.ISBN 9789810226374.2018년 4월 20일 검색.
[2] https://en.wikipedia.org/wiki/Graph_database