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사용갤럭시 서버
창(기능 상자)
왼쪽의 Tools 창에는 다양한 도구가 표시되고, 오른쪽의 History 창에는 지금까지의 분석 및 데이터 이력이 표시됩니다.

위 메뉴에는 신규 사용자 로그인과 로그인에 대한'Loginor Register'등의 정보가 나와 있으니 신경 쓰지 말고 우선 이렇게 사용하십시오

NCBI에서 fasta 형식으로 기본 데이터 가져오기
Tools 창의 Get Data를 클릭하면 Get Data 분류에 포함된 도구의 목록이 표시됩니다.Upload File from your computer 를 클릭합니다.

아래와 같은 절차는 아래와 같다
Get Data => Upload File from your computer
Upload File from your computer를 사용하여 데이터 등록
갤럭시에 적당한 Fasta 배열을 등록하기 위해 Enterrez의fetchapi를 활용해
Genbank ID를 지정해서 Fasta 정렬을 받아보세요.
Upload File을 클릭하여 열린 창 오른쪽 아래에 있는 "Paste/Fetch data"버튼을 클릭합니다


다음 내용을 이전 화면의 영역으로 복사하고 붙여넣기

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=M24811&rettype=fasta&retmode=text

Type 드롭다운 목록을 "fasta"로 변경하고 창 오른쪽 아래에 있는 "Start"를 클릭하십시오.

Status가 100%가 되면 "Close"를 클릭합니다.

History 창에 다운로드 내역 표시

일부 경우, 이 부분의 배경은 노란색으로 실행 중임을 나타낼 수 있습니다
그때는 집행이 끝나기 전에 조금만 기다려주세요.
Blast 실행
BLAST 도구를 이용해서 아까 등록된 Fasta의 배열을 동조 검색해보도록 하겠습니다.
NCBI BLAST+ => NCBI BLAST + blastn Search nucleotide database with nucleotide query sequence(s)
찾기 어려울 수도 있으니까 신중하게 절차를 설명해 주세요.
Tools 창을 아래로 스크롤하여 NCBI BLAST 찾기 + 클릭

그런 다음 Tools 창을 아래로 스크롤하고 NCBI BLAST + blastn Search nucleateide database with nucleateide query sequence(s)를 클릭합니다.

Nucleotide query sequence(s)의 드롭다운 목록에 아까 정렬이 지정되어 있는지 확인합니다. Nucleotide Blast 데이터 베이스의 "Select/Unselect all"체크 상자에서 선택하십시오.

참조할 수 있는 배열이 상자 안에 표시되기 때문에 "phiX174"이외의 "x"부분을 클릭하여 다른 배열을 대상에서 제거합니다
또한, Type of BLAST의 라디오 버튼으로 "blastn-short-BLASTN program optimized for sequences shorter than 50bases"를 클릭한다.

("phiX174"를 잘못 삭제했을 때 "Select/Unseelect all"콤보 상자를 클릭하여 2회 다시 실행)
Execute를 클릭하여 실행

아래 화면에서 BLAST 대기 중 확인 가능
끝날 때까지 걸리는 시간은 갤럭시 서버가 붐비는 상황에 따라 다르니 당황하지 말고 조금만 기다려주세요.
History 창이 녹색으로 표시될 때 종료

눈동자 모양 아이콘을 클릭하여 결과를 확인합니다

출력 결과는 중요하지 않으므로 처리 시간을 절약하기 위해 PhiX 어레이의 일부를 PhiX와 비교합니다.
이렇게 하면 미등록 사용자도 갤럭시 도구를 이용할 수 있다
Enterz Programing Utilities 정보
여기에 사용된 EFetchhttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi에 대한 자세한 내용은 아래 링크를 참조하십시오.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25499/#_chapter4_EFetch_
이번에는fasta 형식으로 GenBank에서 다음과 같은 기술에서 배열 데이터를 얻었다

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=M24811&rettype=fasta&retmode=text

매개 변수
컨텐트 지정
금번
db
데이터베이스 이름
nuccore
id
가져올 데이터베이스 ID
M24811
rettype
데이터 출력 형식
fasta
retmode
서버에서 전송할 때의 데이터 형식
text
이번엔 여기까지