갤럭시 공용 서버에 가입해 보세요.
6829 단어 Galaxy
갤럭시 Workflow 및 Visualize 기능을 사용하려면 사용자 로그인이 필요합니다.
사용자 로그인을 통해 얻은 내용은 공공 서버에 따라 크게 다음과 같다.
등록 시 메일 주소 필요
이번에도 공공갤럭시 서버을 이용하기로 했어요.
화면 위 메뉴 오른쪽에 있는 "Loginor Register"를 클릭하고 드롭다운 메뉴에서 "Register"를 선택합니다.
"Create Accent"패널이 중심에 표시됩니다.
자신의 메일 주소
"Password:"및 "Confirm password:"이 갤럭시용 비밀번호
Public name: 에서 갤럭시에 표시된 이름 3개 이상의 이름을 입력합니다(영문자로 소문자, 숫자, 마침표, 밑줄 사용 가능).
마지막으로 "Submit"을 클릭하여 등록
화면이 바뀌었다. "Your account has not been activated yet. Feel free to browsearand see what's avilable, but youwon't be able to upload data or run jobs until you have verified your email address."다음으로 표시
갤럭시 서버가 등록된 메일 주소로 메일을 보냈기 때문에 메일 내용을 확인하고
https://usegalaxy.org/activate?
부터 링크를 클릭하세요메르가 도착하기 전에 시간이 좀 걸릴 수도 있어요.
그리고 "Return to the home page"링크를 클릭하십시오.
Mail 링크를 클릭하지 않고 메인 화면으로 돌아가면 활성화가 끝나지 않은 주의사항이 표시됩니다
어떤 도구가 있는지 확인할 수 있지만 해석할 수 없는 상태
이 메시지가 나타나면 받은 메일 링크를 클릭하여 활성화를 완료하십시오
Workflow 만들기
사용자 로그인이 끝났습니다. 드디어 Workflow를 만들어 보도록 하겠습니다.
화면 위에 있는 "Workflow"를 클릭하세요.
"Your Workflows"표시
아직 어떤 작업 절차도 등록하지 않았기 때문에 목록의 내용은 비어 있다
"+"를 클릭하여 새 워크플로우 등록
"Create Workflow"패널에 표시
워크플로우 프로세스 이름은 Name 입니다.
Annotation에 설명을 입력하십시오.
"Save"클릭
Workflow Canvas 표시
왼쪽 Tools 창의 NCBI BLAST+=>NCBI BLAST+blastn Search nucleateide database with nucleateide query sequence(s) 화면에 "NCBI BLAST+blastn"모듈이 표시됩니다
화면 오른쪽의 Details에서 매개변수 설정
지난번과 마찬가지로phiX174를 지정합니다
[Type of Blast]의 라디오 버튼으로 [blast-short]를 선택합니다.
Output format 드롭다운 목록에서 Pairwise HTML 지정하기
Workflow Canvas 제목⚙태그 클릭
드롭다운 목록에서 "Save"를 클릭하여 제작 워크플로우를 저장합니다.
새 Workflow 등록
NCBI에서 Fasta를 얻었어요.
지난번과 마찬가지로 NCBI에서 페스타 형태의 알칼리 배열을 얻어 등록한다
하지만 이번엔 Get Data=> Upload File from your computer의 바로 가기 키가 되는 Tool 창의 아이콘을 클릭하세요
다음 단계는 저번과 같습니다.
다음 텍스트 복사 및 붙여넣기
https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=M24811&rettype=fasta&retmode=text
Name에 fasta를 PhyXType으로 지정하고 Start를 클릭합니다.Status가 100%가 되면 "Close"를 클릭합니다.
화면 위에 있는 "Workflow"를 클릭하세요.
워크플로우 목록에서 방금 작성한 워크플로우 이름 옆의 아래쪽 삼각형을 클릭하고 드롭다운 목록에서 Run을 선택합니다.
설정된 변경 사항이 없으므로 "Run workflow"를 클릭하여 워크플로를 수행합니다.
실행이 끝나면 History 창의 해당 부분이 녹색으로 바뀝니다.
"눈동자 표시"아이콘을 누르면 결과를 표시합니다
이번엔 여기까지
Reference
이 문제에 관하여(갤럭시 공용 서버에 가입해 보세요.), 우리는 이곳에서 더 많은 자료를 발견하고 링크를 클릭하여 보았다 https://qiita.com/percipere/items/b5cf6db4e80ea759e5ac텍스트를 자유롭게 공유하거나 복사할 수 있습니다.하지만 이 문서의 URL은 참조 URL로 남겨 두십시오.
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