Anaconda & Jupyter 환경 구축

1. install
설치Homebrew 후 다음 작업을 수행합니다.

$ brew install pyenv
$ pyenv install anaconda3-2.5.0

GUI 설치 프로그램이 있는 것 같은데 이쪽에서는 사용하지 않습니다.
GUI 를 사용하여 프로그램을 설치하는 절차도 있습니다.

Anaconda install | Continuum Analytics: Documentation

2. Test drive
튜토리얼을 제공했으니까 먼저 해보세요.

Test drive — Conda documentation

이곳의 내용은 다음 라벨에 총결산되어 있다.

conda_cheatsheet_2016

2-1. 관리 anaconda
설치 확인
버전 내보내기 설치 확인

$ conda --version

버전이 있어야 하는데 안 나와요.

pyenv: conda: command not found

The `conda' command exists in these Python versions:
  anaconda3-2.5.0

Pyenv에 설치되어 있습니다. Global에 설치되어 있지 않기 때문입니다.
작업용 폴더를 만들고pyenv를 이용하여anaconda를 설치합니다.

$ pyenv local anaconda3-2.5.0 
$ conda --version
conda 3.19.1

이번에 다 했어요.
업데이트
Anaconda를 최신 버전으로 업데이트합니다.

$ conda update conda

설치를 마치자마자 문제가 없다고 느꼈지만, 여전히 일반적인 업데이트를 진행하였다
2-2. 작업 환경 관리
Anaconda는 작업 환경을 만들고 저장할 수 있습니다.이 부근은 R과 매우 비슷하다.
작업 환경 만들기
바이오파이썬을 위한 스노우플랙스라는 환경이 마련됐다.이름이 교과서를 모방했다.

$ conda create --name snowflakes biopython

biopython의 다운로드와 설정을 시작하고 다음 메시지를 표시합니다.

#
# To activate this environment, use:
# $ source activate snowflakes
#
# To deactivate this environment, use:
# $ source deactivate
#

당장 유효성을 시험해 보자.

$ source activate snowflakes
usage: grep [-abcDEFGHhIiJLlmnOoqRSsUVvwxZ] [-A num] [-B num] [-C[num]]
    [-e pattern] [-f file] [--binary-files=value] [--color=when]
    [--context[=num]] [--directories=action] [--label] [--line-buffered]
    [--null] [pattern] [file ...]
pyenv: -bash: command not found

[プロセスが完了しました]

무슨 일이 일어났는지 이해가 안 돼서 그냥 놔두고 계속 전진하는 거야.
2-3. 파이썬 버전 관리
pyenv 캐릭터와 겹치니 싫은 예감만 들 수밖에 없다.놓아두고 전진하지 않다.
2-4. Anaconda의 포장 관리
설치 가능한 매크로 패키지 목록 표시