BS-Methylation

메 틸 화 측정 순서 분석 절차

참조 게놈 과 reads 를 예비 처리 - C 를 모두 T 로 교체 - 서열 을 역방향 으로 상호 보완 하고 G 를 A

로 교체

예비 처 리 된 reads 를 참고 게놈 에 비교 하고 결과 의 시퀀스 정 보 를 원시 reads (즉, C 전 T 를 하지 않 은 reads)

로 비교 합 니 다.

메 틸 화 비트 CpG CpHpG CHH (H = A, T, G)

메 틸 화 구역 과 기능

가동 자 구역 - 유전자 발현 억제

동 식물 에서 활발 하 게 전 록 된 유전자 CpG 메 틸 화 정도 상승

CpHpG 는 식물 에서 표현 하지 않 는 자리 에 존재 한다

메 틸 화 측정 전략 - BS - seq

WGBS

 
     ，Raw-data      ，       
  - RRBS
WGBS     
  
 This technique combines restriction enzymes and bisulfite sequencing in order to
 enrich for the areas of the genome that have a high CpG content. Due to the high cost
 and depth of sequencing needed to analyze methylation status in the entire genome,
 Meissner et al. developed this technique in 2005 in order to reduce the amount of
 nucleotides needed to be sequenced to 1% of the genome.

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