갤럭시 트레이닝'From peaks to genes'추가

3604 단어 Galaxy
NGS 데이터 분석 플랫폼'갤럭시'의 튜토리얼'From peaks to genes'일본어 버전를 만들 때
"여기 몰라!""튜토리얼처럼 하면 안 돼!"
그런 부분이 있는 것 같아서 추가 설명.
(상기 일본어판 기사와 함께 읽어주세요)
갤럭시 등록
우선 갤럭시 관련 로그인 기사는 거의 언급되지 않았으며, 지금부터 설명하겠다.
  • 갤럭시 상단에 있는 사용자(또는 User)(아래 그림의 빨간 상자 부분)를 클릭하고 등록을 선택합니다.
  • 다음 화면이 나오기 때문에 필요사항을 적고 Submit을 클릭한다.
  • 입력한 메일 주소에 등록 확인된 메일이 왔기 때문에 해당 메일의 URL을 클릭합니다.
  • 등록 완료!!
  • 도구 재실행 정보
    도구Replace Text on data ...를 다시 실행할 때'이 작업을 다시 실행'단추가 어디에 있는지 모르는 사람을 대상으로 합니다.
  • History 패널(오른쪽 패널)에서 Replace Text on data ...를 클릭하여 객체의 이력을 확장합니다.
  • 형식과 데이터베이스가 적힌 칸 아래에 5개의 아이콘을 표시해야 한다.루프 화살표 아이콘(가운데 아이콘)은 재실행 버튼입니다.
  • 클릭하면 도구의 설정 화면이 중앙 패널에 나타날 수 있습니다. 강좌에 따라 각종 설정을 하고 다시 실행하십시오.
  • 시각화 정보
    (2018.06.14시 내용)
    갤럭시 업데이트에 따라 튜토리얼의 글처럼 손으로 열 수 없어진다(가시화 자체가 가능하다).
    시각화 정보
    시각화된 (chart) 아이콘 클릭 → 중앙 패널에서 보기 좋은 그래프 선택 → 다양한 설정 시도
    이런 순서에 따라 각 염색체의 유전자수를 알 수 있는 스트라이프를 만들어 보세요.
    워크플로우 추출 정보
    나는 몇 가지 이해하기 어려운 부분이 있다고 생각한다. 아래에 조를 나누어 열거해라. (만약 다른 이해하기 어려운 부분이 있으면 언제든지 메시지를 남겨라.)
  • 입력한 데이터 세트의 이름 변경 섹션입니다.GEO에서 올라온 피크 파일의 이름을 Peak regions로, UCSC에서 올라온 마우스의 유전자 목록을 Reference regions로 설정했다.
  • Auto Re-layout 이후의 워크플로우 레이아웃은 다음 그림과 같이 올바르게 작성됩니다.
    튜토리얼(입력한 데이터 세트의 이름을 분명히 바꿨음)에서 둘 다'인풋 데이터셋'상태로 연결된 그림이라 이해하기 어렵다.그러나 데이터를 입력한 연결 주소가 거꾸로 바뀌면 이후 손잡이(작업흐름 설정을 바꾸어 실행)가 오류를 일으켜 골치 아픈 사태에 빠질 수 있으니 주의하세요.
  • 유전인자 명칭 취득에 관한 부분
    (2018.06.14시 내용)
    Galaxy에서 데이터베이스에서 데이터를 가져오려면 데이터베이스에서'Training data'를 찾을 수 없고 가져올 수 없습니다. 따라서 링크에서 데이터를 가져오거나 파일을 로컬로 잃어버린 후에 가져오십시오.
    From peaks to genes에 대한 추가 설명입니다.
    또 다른 모르는 점이 있으면 댓글을 남기거나 참가갤럭시 워크숍해 주세요.
    링크 등
  • From peaks to genes의 원문http://galaxyproject.github.io/training-material/topics/introduction/tutorials/galaxy-intro-peaks2genes/tutorial.html
  • From peaks to genes 일본어 버전(https://github.com/A-Asai/training-material/blob/master/topics/introduction/tutorials/galaxy-intro-peaks2genes/tutorial_ja_notag.md)
  • Galaxy( https://usegalaxy.org/ )
  • Galaxy Seminar( https://pitagora.connpass.com/ )
  • 좋은 웹페이지 즐겨찾기