ggplot2 ggplot2 (R 언어)로 volcano plot을 그리는 RNA-seq 분석 volcano plot은 RNA-seq 해석을 할 때 발현 비교 해석의 결과를 나타내는 그래프 중 하나입니다. 을 이전 기사로 했습니다만, 이번은 시뮬레이션 데이터를 작성해, 거기로부터 ggplot2를 이용해 volcano plot를 그리는 방법을 비망록으로서 정리하고 싶습니다. 또한, 필자가 사용한 R studio는 Version 1.4.1106, R은 version 4.0.5를 사용했습니... ggplot2RRNA-seq Jupyter R kernel에서 ggplot 그래프에 일본어가 표시되지 않는 문제를 해결합니다. Jupyter notebook에서 다음 R 코드를 실행하면, 자신의 우분투 18.04 환경에서는 다음 출력이 되었다. 다음 중 어느 것도 작동하지 않았다. theme(text=element_text(family="font-name")) 에서 글꼴 지정 extrafonts 에서 글꼴 로딩 quartzFonts()로 글꼴 이름 등록 그런데, ggsave 를 사용해 파일에 쓸 때 제대로 출력되고 ... ggplot2RJupyter 고고학을 위한 커널 밀도 추정 매장 문화재 포장지 데이터를 사용한 커널 밀도 추정의 수법을 소개합니다. 에서는 ggplot2 의 기능을 이용한 커널 밀도 추정도를 작성했습니다만, 보다 범용성이 높고, 사용이 잘 되는 커널 밀도 추정도를 작성합니다. 필요한 패키지는 여기입니다. 클래식한 것 외에도 lwgeom 패키지라는 것을 설치합니다. 포장지 다각형 데이터에 결함이 있으므로 결함이 있는 데이터를 제외한 전처리가 필요합니다... ggplot2RGISGISTools 홋카이도 매장 문화재 포장지 데이터를 이용해 유적 분포도를 ggplot2로 작성한다 이 데이터를 사용하여 고고학자를위한 유적 분포도를 만드는 방법을 소개합니다. 포장지 데이터는 포인트 데이터와 다각형 데이터로 나뉩니다. 포인트 데이터는 6750건, 다각형 데이터는 5498건입니다. 그 외에 국토 수치 정보의 시정촌계 데이터를 읽어들입니다. 공개된 폴리곤 데이터에 결함이 있는 것 같고, 그대로는 폴리곤 데이터를 포인트 데이터로 변환하는 작업이 잘 되지 않습니다. 다음과 같은 ... ggplot2RGIS 【ggplot2/R】stat_function() 함수로 회귀 직선을 쓴다 비망록적인 메모입니다. 먼저 회귀 모델을 만듭니다. C1: 설명 변수 C2:목적 변수 DF: 데이터 프레임 그런 다음 회귀 계수의 매개 변수 값을 검색하고 표시합니다. ggplot() 함수와 stat_function() 함수를 결합하면 이 매개 변수의 값을 사용하여 회귀선을 그릴 수 있습니다. fun = function(x) 뒤에 x 함수를 설명합니다. x는 먼저 ggplot()에 지정된 x... ggplot2RRStudio 【ggplot2/R】ELISA의 측정 결과로부터 4계수 로지스틱 곡선(4-parameter logistic curve)을 쓴다 R을 사용하여 ELISA 측정값에서 4계수 로지스틱 곡선을 그리는 방법을 소개합니다. ggplot() 함수와 stat_function() 함수를 조합하여 작성합니다. 이번에 사용할 데이터 (ELISA.csv)입니다. Concentration Absorbance R을 사용하여 4계수 로지스틱 회귀 분석을 위해 drc 패키지를 설치하고 로드합니다. 그리고 dplyr와 ggplot2를 일괄 적으로... ggplot2RRStudiobiostatistics R의 평소 주문은 snippet RStudio로 스크립트를 쓸 때는 언제나 이하를 선두에 쓰도록 하고 있다. 이제 mac에서도 plot/ggplot2에서 제대로 일본어가 나온다. 항상 쓰기 때문에 RStudio Tools > Global Options... > Code > Enable code snippets 옆의 Edit snippets 에 등록해 둔다. 이하를 그대로, 코멘트나 공행도 포함해 등록할 수 있다. 훌륭합니다... Rggplot2RStudio일본어플롯 ggplot, ggvis의 산점도와 iris에서 k-nn k-nn은 완전히 덤. 좋아하는 산포도 코드를 비망록으로 남긴다.... ggplot2R기계 학습비망록 【R】[ggplot2] 산점도에 x축·y축을 추가하고 싶다(4상한 매트릭스) R에서 다음과 같은 그림을 플롯하고 싶었기 때문에, X 축과 Y 축을 추가하는 방법을 살펴 보았습니다. 화살표에 대해서는 등 몇 가지 방법이 있는 것 같습니다만, geom_hline · _vline을 사용하는 다음 방법으로 일단 만족했습니다. plot_quadrant_matrix.R 출력 어느 정도는 이미지를 재현할 수 있었습니다만, point를 클릭하고 싶어지기 때문에 googleVis와 ... ggplot2RRStudio 도쿄도 지사 선거(2016년) 개표 결과를, R(ggplot)로 가시화합니다 R의 그래프 드로잉 라이브러리 ggplot을 이용하여 도쿄도 지사 선거의 개표 정보를 시각화합니다. '전체 21명의 후보자와 득표수와의 관계'에 대한 막대 그래프를 작성했습니다. excel에서도 충분히 같은 일을 할 수 있기 때문에, R을 사용하는 메리트라고 하면, 좋아하는 것처럼 눈금을 조정할 수 있었던 것입니까. R: 3.3.0 RStudio: Version 0.99.896 Rstudio... ggplot2R그래프시각화 ggplot::geom_flat_violin 추천 나는 가 만든 ggplot2용 을 좋아하며 잘 사용하고 있습니다. 그러나, 이 플롯을 들여 주시고 있던 하테나 블로그의 기사가 어느새 사라지고 있어 슬퍼했기 때문에 간단하게 사용법을 정리해 보았습니다. 불행히도 스크립트에는 불필요한 ")"가 포함되어 있으므로 한 번 에서 다운로드하고 50 번째 줄에있는 ")"를 지우십시오. 아래 코드를 실행하면 필요하지 않음)에 대한 오류 메시지를 볼 수 있... ggplot2R R 언어 : 다중 카테고리 boxplot + jitterplot 문제 boxplot+jitterplot로 보여주거든 t 검정하라고 말하지 않는다는 것을 이해한 와이. 한쪽 끝에서 box jitter하고 있었던 것이다. 문제는 결손 범주가 나타날 때 발생했습니다. 라고 한다. 1 0.52 Ideal H VS1 61 56 1699 5.15 5.23 3.17 3 0.31 Premium H VVS2 62.6 60625 4.29 4.33 2.7 5 0.33 Ideal ... ggplot2Rboxplotjitter 고고학을 위한 R 통계 분석 ~ Ben Marwick 선생님의 수업을 복습한다(ANOVA편)~ 이 기사는 2020년 5월 7일에 열린 '제2회 고고학을 위한 R 통계 분석'의 복습입니다. 마지막 과 의 속편입니다. 사용하는 데이터는, 전회와 같이, 홋카이도 매장 문화재 센터씨의 (북매조보 356, p234-243)의 석기 일람표 데이터를 사용했습니다. 길이와 너비를 실수형으로 변환하고 노브 나이프를 추출합니다. ANOVA(분산 분석)는 3개 이상의 카테고리 사이에 차이가 있는지 여부와... ggplot2Raovinfer ggplot에서 테두리가 있는 눈금선이 없는 그래프 만들기 ggplot2R 독서노트 도형의 문법은 한 장의 도형이 데이터(data)에서 기하학적 대상까지의 도형 속성의 매핑(mapping)이라는 것을 알려준다.도형에는 데이터의 통계 변환도 포함되어 있으며 최종적으로 특정한 좌표계에 그려진다.또한 분면은 데이터의 서로 다른 서브집합을 생성하는 도형에 사용할 수 있다.총괄적으로 말하면 통계 도형은 상술한 독립된 도형 부품으로 구성된 것이다. - 기하학적 대상(Geometric,... ggplot2
ggplot2 (R 언어)로 volcano plot을 그리는 RNA-seq 분석 volcano plot은 RNA-seq 해석을 할 때 발현 비교 해석의 결과를 나타내는 그래프 중 하나입니다. 을 이전 기사로 했습니다만, 이번은 시뮬레이션 데이터를 작성해, 거기로부터 ggplot2를 이용해 volcano plot를 그리는 방법을 비망록으로서 정리하고 싶습니다. 또한, 필자가 사용한 R studio는 Version 1.4.1106, R은 version 4.0.5를 사용했습니... ggplot2RRNA-seq Jupyter R kernel에서 ggplot 그래프에 일본어가 표시되지 않는 문제를 해결합니다. Jupyter notebook에서 다음 R 코드를 실행하면, 자신의 우분투 18.04 환경에서는 다음 출력이 되었다. 다음 중 어느 것도 작동하지 않았다. theme(text=element_text(family="font-name")) 에서 글꼴 지정 extrafonts 에서 글꼴 로딩 quartzFonts()로 글꼴 이름 등록 그런데, ggsave 를 사용해 파일에 쓸 때 제대로 출력되고 ... ggplot2RJupyter 고고학을 위한 커널 밀도 추정 매장 문화재 포장지 데이터를 사용한 커널 밀도 추정의 수법을 소개합니다. 에서는 ggplot2 의 기능을 이용한 커널 밀도 추정도를 작성했습니다만, 보다 범용성이 높고, 사용이 잘 되는 커널 밀도 추정도를 작성합니다. 필요한 패키지는 여기입니다. 클래식한 것 외에도 lwgeom 패키지라는 것을 설치합니다. 포장지 다각형 데이터에 결함이 있으므로 결함이 있는 데이터를 제외한 전처리가 필요합니다... ggplot2RGISGISTools 홋카이도 매장 문화재 포장지 데이터를 이용해 유적 분포도를 ggplot2로 작성한다 이 데이터를 사용하여 고고학자를위한 유적 분포도를 만드는 방법을 소개합니다. 포장지 데이터는 포인트 데이터와 다각형 데이터로 나뉩니다. 포인트 데이터는 6750건, 다각형 데이터는 5498건입니다. 그 외에 국토 수치 정보의 시정촌계 데이터를 읽어들입니다. 공개된 폴리곤 데이터에 결함이 있는 것 같고, 그대로는 폴리곤 데이터를 포인트 데이터로 변환하는 작업이 잘 되지 않습니다. 다음과 같은 ... ggplot2RGIS 【ggplot2/R】stat_function() 함수로 회귀 직선을 쓴다 비망록적인 메모입니다. 먼저 회귀 모델을 만듭니다. C1: 설명 변수 C2:목적 변수 DF: 데이터 프레임 그런 다음 회귀 계수의 매개 변수 값을 검색하고 표시합니다. ggplot() 함수와 stat_function() 함수를 결합하면 이 매개 변수의 값을 사용하여 회귀선을 그릴 수 있습니다. fun = function(x) 뒤에 x 함수를 설명합니다. x는 먼저 ggplot()에 지정된 x... ggplot2RRStudio 【ggplot2/R】ELISA의 측정 결과로부터 4계수 로지스틱 곡선(4-parameter logistic curve)을 쓴다 R을 사용하여 ELISA 측정값에서 4계수 로지스틱 곡선을 그리는 방법을 소개합니다. ggplot() 함수와 stat_function() 함수를 조합하여 작성합니다. 이번에 사용할 데이터 (ELISA.csv)입니다. Concentration Absorbance R을 사용하여 4계수 로지스틱 회귀 분석을 위해 drc 패키지를 설치하고 로드합니다. 그리고 dplyr와 ggplot2를 일괄 적으로... ggplot2RRStudiobiostatistics R의 평소 주문은 snippet RStudio로 스크립트를 쓸 때는 언제나 이하를 선두에 쓰도록 하고 있다. 이제 mac에서도 plot/ggplot2에서 제대로 일본어가 나온다. 항상 쓰기 때문에 RStudio Tools > Global Options... > Code > Enable code snippets 옆의 Edit snippets 에 등록해 둔다. 이하를 그대로, 코멘트나 공행도 포함해 등록할 수 있다. 훌륭합니다... Rggplot2RStudio일본어플롯 ggplot, ggvis의 산점도와 iris에서 k-nn k-nn은 완전히 덤. 좋아하는 산포도 코드를 비망록으로 남긴다.... ggplot2R기계 학습비망록 【R】[ggplot2] 산점도에 x축·y축을 추가하고 싶다(4상한 매트릭스) R에서 다음과 같은 그림을 플롯하고 싶었기 때문에, X 축과 Y 축을 추가하는 방법을 살펴 보았습니다. 화살표에 대해서는 등 몇 가지 방법이 있는 것 같습니다만, geom_hline · _vline을 사용하는 다음 방법으로 일단 만족했습니다. plot_quadrant_matrix.R 출력 어느 정도는 이미지를 재현할 수 있었습니다만, point를 클릭하고 싶어지기 때문에 googleVis와 ... ggplot2RRStudio 도쿄도 지사 선거(2016년) 개표 결과를, R(ggplot)로 가시화합니다 R의 그래프 드로잉 라이브러리 ggplot을 이용하여 도쿄도 지사 선거의 개표 정보를 시각화합니다. '전체 21명의 후보자와 득표수와의 관계'에 대한 막대 그래프를 작성했습니다. excel에서도 충분히 같은 일을 할 수 있기 때문에, R을 사용하는 메리트라고 하면, 좋아하는 것처럼 눈금을 조정할 수 있었던 것입니까. R: 3.3.0 RStudio: Version 0.99.896 Rstudio... ggplot2R그래프시각화 ggplot::geom_flat_violin 추천 나는 가 만든 ggplot2용 을 좋아하며 잘 사용하고 있습니다. 그러나, 이 플롯을 들여 주시고 있던 하테나 블로그의 기사가 어느새 사라지고 있어 슬퍼했기 때문에 간단하게 사용법을 정리해 보았습니다. 불행히도 스크립트에는 불필요한 ")"가 포함되어 있으므로 한 번 에서 다운로드하고 50 번째 줄에있는 ")"를 지우십시오. 아래 코드를 실행하면 필요하지 않음)에 대한 오류 메시지를 볼 수 있... ggplot2R R 언어 : 다중 카테고리 boxplot + jitterplot 문제 boxplot+jitterplot로 보여주거든 t 검정하라고 말하지 않는다는 것을 이해한 와이. 한쪽 끝에서 box jitter하고 있었던 것이다. 문제는 결손 범주가 나타날 때 발생했습니다. 라고 한다. 1 0.52 Ideal H VS1 61 56 1699 5.15 5.23 3.17 3 0.31 Premium H VVS2 62.6 60625 4.29 4.33 2.7 5 0.33 Ideal ... ggplot2Rboxplotjitter 고고학을 위한 R 통계 분석 ~ Ben Marwick 선생님의 수업을 복습한다(ANOVA편)~ 이 기사는 2020년 5월 7일에 열린 '제2회 고고학을 위한 R 통계 분석'의 복습입니다. 마지막 과 의 속편입니다. 사용하는 데이터는, 전회와 같이, 홋카이도 매장 문화재 센터씨의 (북매조보 356, p234-243)의 석기 일람표 데이터를 사용했습니다. 길이와 너비를 실수형으로 변환하고 노브 나이프를 추출합니다. ANOVA(분산 분석)는 3개 이상의 카테고리 사이에 차이가 있는지 여부와... ggplot2Raovinfer ggplot에서 테두리가 있는 눈금선이 없는 그래프 만들기 ggplot2R 독서노트 도형의 문법은 한 장의 도형이 데이터(data)에서 기하학적 대상까지의 도형 속성의 매핑(mapping)이라는 것을 알려준다.도형에는 데이터의 통계 변환도 포함되어 있으며 최종적으로 특정한 좌표계에 그려진다.또한 분면은 데이터의 서로 다른 서브집합을 생성하는 도형에 사용할 수 있다.총괄적으로 말하면 통계 도형은 상술한 독립된 도형 부품으로 구성된 것이다. - 기하학적 대상(Geometric,... ggplot2