Trinity Inchworm 알고리즘 속에서 이용되고 있는, read를 대략적으로 조립해 contig를 생성하는 알고리즘입니다. 여기에서는 그 개요를 기술하고 있습니다. 리드, 커버리지에 대한 설명은 을 참조하십시오. 여기에서는 7 염기에 주목해 갑니다(k-mer의 k=7로 합니다). 위 그림의 왼쪽과 같이 GATTACA라는 7 염기 서열의 커버리지가 10이라고 가정합니다. 가장 오른쪽 A에서 1 염기 분만큼 가지를 늘려갑니다.... bioinformaticsTrinityInchworm
Inchworm 알고리즘 속에서 이용되고 있는, read를 대략적으로 조립해 contig를 생성하는 알고리즘입니다. 여기에서는 그 개요를 기술하고 있습니다. 리드, 커버리지에 대한 설명은 을 참조하십시오. 여기에서는 7 염기에 주목해 갑니다(k-mer의 k=7로 합니다). 위 그림의 왼쪽과 같이 GATTACA라는 7 염기 서열의 커버리지가 10이라고 가정합니다. 가장 오른쪽 A에서 1 염기 분만큼 가지를 늘려갑니다.... bioinformaticsTrinityInchworm