papermill을 사용해 보았습니다.

을 읽고, 기초에 jupyter notebook를 직접 짜넣다니 할 수 있을까 매우 감탄했습니다. 기사 속에서 jupyter notebook을 외부에서 실행할 수 있는 'papermill'이라는 라이브러리가 등장했으므로, 이것을 사용해 보고 싶습니다. macOS Catalina 10.15.3(19D76) 파이썬 3.7.5 폴더 구성은 다음과 같이 했습니다. input.ipynb에서 실행하려는...

Jupyter-notebook파이썬Papermill

papermill × Jupyter Notebook에서 문서화된 분석 워크플로 만들기

하지만 쓴 것처럼, 워크플로우에 문장이나 이미지를 관련짓게 하고 싶은데, 라는 Jupyter Notebook을 배치 실행하기 위한 Python 패키지가 있었으므로, 이것을 사용해 워크플로우를 구축했다. 여기에서는 1세포 RNA-Seq의 데이터 data/input.csv와 라벨 정보 data/label.csv라는 파일에 대해, 복수의 차원 압축을 시험하는 작업을 한번에 실시했다. 또한 R을 J...

RPapermill노트북Jupyter

papermill과 commuter로 JupyterNotebook 중심의 워크플로우 실현

JupyterNotebook만으로 전처리도 모델 개발도 전부 하고 싶다-(특히 PoC 페이즈라고), 하지만 관리 어떻게 할까-라고 생각하고 있던 곳에 아래 기사(및 그 관련 기사)를 읽고,papermill와 commuter 라는 좋은 느낌의 OSS를 알았으므로 사용해 보았습니다. 각 데이터 사이언티스트/엔지니어가 각자의 로컬 환경에서 JupyterNotebook에서 전처리나 모델 개발 노트북...

커뮤터PapermillJupyter-notebookJupyterS3